Pen drive e flash drive executam a mesma função essencial; no entanto, muitas pessoas confundem os termos. Coloquialmente, referem-se a ambos como se fossem o mesmo dispositivo. Isto porque todos os pen drives são flash drives. Dito isto, é importante notar que flash drives têm usos que vão além das capacidades de pen drive.
A principal diferença é que pen drive é geralmente usado apenas como dispositivo de armazenamento USB móvel, enquanto flash drive tem muitos usos diferentes para armazenamento de dados. Outra diferença: pen drive refere-se sempre a drive que liga diretamente a porta USB. Flash drive pode ser acessível por ligação USB direta, cabo USB, ou até armazenado internamente num telemóvel ou dispositivo móvel.
Geralmente, flash drive é qualquer dispositivo de armazenamento que guarda dados com partes não móveis. Antes, usavam-se disquetes e CDs para pequenos dados. Ao inserir disco ou CD, computador lê através de partes móveis, como laser a ler CD. Como flash drive não tem partes móveis, é menos suscetível a danos. Outra vantagem: compatibilidade quase universal com variedade de dispositivos. Para transferir dados entre dois dispositivos, ambos precisam porta USB ou adaptador, mas a maioria dos computadores e produtos eletrónicos contemporâneos têm porta USB. Isto significa que além de backup em computador, flash drives também guardam informação de consolas, dispositivos móveis e telemóveis.
Pen drive é tipo de flash drive nomeado pela aparência pequena tipo caneta. Podem ser inseridos diretamente numa porta USB sem cabo. Devido à falta de cabo, é extremamente móvel e pode prender-se a chaveiro ou bolso.
Segundo site da Phison, termo "pen drive" entrou no vocabulário informático em 2001. Phison desenvolveu dispositivo de armazenamento removível chamado "pen drive". Desde então, pen drive tornou-se sinónimo incorreto de todos os flash drives USB.
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