Usado para diversos propósitos. Usa fonte de luz (luz ou espelho) e lentes de ampliação. Há lente objetiva (mais próxima do objeto) e ocular (lente de visualização). As lentes criam visão ampliada. Geralmente tem quatro lentes de ampliação: 4x, 10x, 40x e 100x. Permite visualizar muitos tipos de objetos microscópicos: células animais e vegetais, bactérias e algas.
Também chamado microscópio de dissecação, é combinação de dois microscópios compostos que permite ver objetos em três dimensões. Os dois microscópios focam a mesma área em ângulos ligeiramente diferentes. Produz imagem vertical. Tem baixa potência, tipicamente abaixo de 100x. Possui diferentes sistemas de ampliação: conjunto único, ampliações separadas e zoom. Permite realizar tarefas em espécimes, como dissecação de células.
Também chamado SEM, forma imagens usando elétrons. Permite visualizar espécimes microscópicos como moléculas e vírus. Tem grande profundidade de campo, permitindo ver muitas partes da amostra de vez. Alta resolução para ampliações elevadas. Não usa lente, usa eletroímãs, permitindo mais controle no nível de ampliação. Imagens produzidas em telas grandes. Desempenha papel importante em ciências físicas e médicas.
Também chamado TEM, opera similarmente a microscópios ópticos, mas usa elétrons. Elétrons têm comprimento de onda menor, criam melhor resolução e altas ampliações. Permite ver detalhes minúsculos de objetos. A fonte no topo libera elétrons que viajam através de vácuo. Lentes eletromagnéticas focam elétrons em feixes finíssimos que atravessam o objeto. Imagens apresentadas em tela fluorescente.
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