As cores dos slots Peripheral Component Interconnect são principalmente estéticas; as cores só significam algo em placas avançadas que usam múltiplos slots para funções singulares. O Peripheral Component Interconnect Special Interest Group, ou PCI-SIG, recomenda que todos os slots PCI Express devem ser pretos, mas não exige um esquema de cores específico. Muitos fabricantes de hardware adotaram esquemas de cores personalizados para PCI Express para adequar às suas placas-mãe porque não há requisito de cor de slot.
Embora a cor oficial do slot PCI Express seja preta, fabricantes frequentemente usam outras cores como azul, amarelo, verde e branco. De acordo com PCI-SIG, os padrões PCI Express originais não especificavam que os slots da placa-mãe tivessem que ser de uma cor específica. No entanto, o PCI-SIG recomenda usar slots pretos para evitar confusão com os slots PCI brancos e slots AGP marrons. O PCI-SIG sugeriu preto porque não estava em uso para nenhum tipo de slot de cartão periférico atual quando PCI Express chegou ao mercado, e a cor preta foi usada pela última vez para o tipo de cartão periférico ISA há muito aposentado. Fabricantes são permitidos a usar um esquema de codificação de cores diferente para atender às necessidades do seu produto.
Os quatro diferentes tipos de slots PCI Express podem ser diferenciados pelo seu tamanho físico. Cartões PCI Express usam tamanhos x1, x4, x8 e x16, que refletem quantas lanes individuais de conector de dados o cartão suporta. O número seguinte ao "x" no nome é matematicamente relevante para o tamanho do conector do cartão. Por exemplo: um slot x8 é duas vezes o tamanho de um slot x4, e um slot x16 é quatro vezes maior que um slot x4.
Cartões PCI Express podem encaixar e funcionar com qualquer slot que tenha tantas ou mais lanes de conector de dados. Por exemplo, um cartão x8 pode encaixar em um slot x16, mas um cartão x16 não pode encaixar em um slot x4. Se o cartão encaixa no slot, ele funciona no slot desde que seja um slot PCI Express — usar um cartão PCI Express em um slot PCI ou AGP pode danificar o hardware. De acordo com PC World, PCI Express é projetado para substituir slots PCI e AGP. No entanto, placas-mãe ainda carregam slots PCI para suporte a dispositivos legados.
Configurações de múltiplas placas gráficas CrossFire e SLI são o principal exemplo de por que o fabricante pode optar por usar um esquema de cores personalizado. Configurações CrossFire e SLI conectam duas placas gráficas a um computador e usam ambas as placas como uma placa mais poderosa. Configurações multi-placa usam dois ou mais slots PCI Express x16. Por exemplo, uma configuração de dois slots pode precisar diferenciar um como slot primário e outro como secundário no caso de o slot secundário rodar mais lento que o primário. Dessa forma, se apenas um cartão for instalado, ele pode ser colocado no slot mais rápido. O manual da placa-mãe conterá informações sobre o que cada cor personalizada de slot PCI Express significa.
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